Leandro de Mattos Pereira

Leandro de Mattos Pereira

Pesquisador e Biólogo (MSc, PhD) - CRBIO2: 143240 com formação interdisciplinar em Biotecnologia, Biologia Computacional e Ciência de Dados. Atuo em bioinformática e análise de dados ômicos (genômica, transcriptômica, proteômica e metagenômica), com experiência em anotação funcional, descoberta de enzimas, reconstrução de vias metabólicas, genômica comparativa e filogenômica, mineração de clusters de genes biossintéticos (BGCs) e análises de metabarcoding/ecologia. Trabalho principalmente com Python e R, aplicando metodologias de ciência de dados e aprendizado de máquina — desde métodos clássicos (Random Forest, SVM e redes neurais profundas) até LLMs (como GPT-J e BLOOM), incluindo fine-tuning e RAG.

Desenvolvo pipelines de ponta a ponta — desde a aquisição e curadoria de dados, passando pelo processamento e modelagem, até a disponibilização de resultados em soluções do tipo Software as a Service (SaaS), incluindo configuração de ambientes, infraestrutura e implantação em produção. Esses pipelines integram machine learning clássico com modelos baseados em transformers (por exemplo, BERT e ESM2) e abordagens baseadas em embeddings (como word2vec) para prever a especificidade de substrato de enzimas. Tenho interesse em integrar Bioinformática e IA para gerar conhecimento aplicável, com impacto em biotecnologia, preservação ambiental e desenvolvimento sustentável.